Во время обновления Asterisk не будет запущен и телефония работать не будет. Учитывайте этот момент!
Для обновления нужно зайти по ssh на ваш asterisk freepbx под учетной записью root или учеткой обладающей правами root. Немного информации. Если у вас старый дистрибутив FreePBX 10.13.66.X максимум вы сможете обновиться до стабильного 13 астериска. Чтобы обновиться на версию выше, нужно обновить FreePBX. Если у вас относительно свежий дистрибутив FreePBX 14-16 вы сможете обновиться до 19 standart астериска. Для обновления достаточно написать команду asterisk-version-switch и выбрать цифрой версию на которую хотите обновиться. После выбора версии, запустится процесс обновления пакетов, затем перезапустится freepbx с применением изменений новой версии. На этом обновление завершено.